بدأ الدكتور سناء الله جونيجو مسيرته الطبية بعد حصوله على بكالوريوس الطب والجراحة، وتابع تدريبه في جراحة القلب في المعهد الوطني لأمراض القلب والأوعية الدموية (NICVD) بكراتشي. بعد ثلاث سنوات من التدريب التخصصي، انضم إلى فريق جراحة القلب في مستشفى ساوث سيتي عام ٢٠١٤، وعمل جنبًا إلى جنب مع البروفيسور شهيد سامي. ومنذ ذلك الحين، يعمل جراح قلب مشاركًا، وهو حاليًا أستاذ مساعد في جامعة داو للعلوم الصحية بكراتشي.